Η Αμαλία Ζέπου υπηρέτησε στο δήμο Αθηναίων ως αντιδήμαρχος από το 2014 έως το 2019. Το 2013 δημιούργησε την πλατφόρμα κοινωνίας των πολιτών «συνΑθηνά», η οποία κέρδισε το βραβείο Bloomberg Philanthropies’ Mayors Challenge τον Σεπτέμβριο του 2014. Την περίοδο 2014-17 εξέλιξε το συνΑθηνά σε μέθοδο τρόπου διακυβέρνησης με παραδείγματα όπως τη διαδικασία επιλογής διαχειριστή για τη Δημοτική Αγορά της Κυψέλης και την στρατηγική αντιμετώπισης του φαινομένου των γκράφιτι στην Αθήνα. Το 2017 ήταν επικεφαλής για την ανάπτυξη και την περαιτέρω διαχείριση μιας ιδέας ένταξης προσφύγων βασισμένη στο δίκτυο ενεργών πολιτών του συνΑθηνά, με τίτλο «Curing the Limbo» που έλαβε στήριξη της Ευρωπαϊκής Επιτροπής για Αστικές Καινοτόμες Δράσεις (UIA). Υπήρξε υπεύθυνη για την ανάδειξη της υποψηφιότητας της Αθήνας ως Ευρωπαϊκή Πρωτεύουσα Καινοτομίας το 2018 και για την ίδρυση του νέου τομέα Κοινωνικής Καινοτομίας στο δήμο Αθηναίων. Σήμερα διαχειρίζεται ευρωπαϊκά προγράμματα με τη νεοσύστατη ΑΜΚΕ ΚΟΛΛΕΚΤΙΒΑ που συν-ίδρυσε το 2020.
Η κ. Ζέπου διδάσκει για το Social Dynamo ενότητες που αφορούν τις συνέργειες της Κοινωνίας των Πολιτών με τον δημόσιο τομέα.